Відносно самостійним напрямком досліджень професора Лук’яненка Д.Г. у 2000-і і подальші роки є проблематика становлення фондового ринку України в інфраструктурному і глобалізаційному контекстах. Будучи головним редактором друкованих видань Державної (на сьогодні Національної) комісії з цінних паперів і фондового ринку України, членом професійних консультаційних і громадських інституцій, Лук’яненко Д.Г. досліджує і висвітлює у співавторстві з професором О.М. Мозговим в редакційних статтях, з його ініціативи заснованого фахового журналу «Ринок цінних паперів України», фундаментальні проблеми фондового ринку, переважно з точи зору його ефективного регулювання у глобально нестабільному фінансовому середовищі.